病因目前仍不清楚，可能是家族性、遺傳性、炎性增生性、其他環境及飲食等相關因素共同引起。腺瘤樣息肉可能與環境因素導致基因異常表達有關；增生性息肉或炎性息肉與感染和損傷有關。
直腸息肉的發病原因有哪些
遺傳因素：一般認爲，息肉形成與基因突變和遺傳因素有密切關係。胎兒在胚胎期，上皮細胞即有易感性。這種特性使上皮細胞在生長發育期快速生長而成息肉。從目前研究情況表明，突變基因可以由父母遺傳給後代子女，在遺傳機會上男女是均等的，沒有性別的差異。
飲食因素：飲食因素與直腸息肉的形成有一定關係，特別是細菌和膽酸相互作用，可能是腺瘤性息肉形成的基礎。
炎症刺激：直腸粘膜長期被炎症刺激;可引起腸粘膜的息肉生成，這是由於腸粘膜的炎症充血水腫，糜爛潰瘍癒合之後，導致疤痕逐漸收縮，形成息肉狀，又由於慢性炎症刺激，致腺體阻塞，粘液儲留而發病。
糞便、異物刺激和機械性損傷：糞便能對直腸粘膜產生的特殊刺激;糞便乾結等均可刺激直腸粘膜而發病。糞便粗渣和異物長期刺激腸粘膜上皮，以及其它原因造成直腸粘膜損傷，使細胞出現異常增生，形成息肉。
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