新生兒一隻眼睛有眼屎的治療方法要根據引起的原因，比如不注意衛生、淚道阻塞、結膜炎、角膜炎、過敏等。
1、不注意衛生
如果日常不注意清潔衛生，沒有及時清除眼屎，眼屎中的細菌和分泌物可能在眼睛周圍積聚。通常可不用特殊治療，注意在接觸新生兒眼睛之前清洗雙手。
2、淚道阻塞
淚道阻塞之後，淚液無法正常排出，從而導致眼屎積聚在眼角。如果症狀比較輕，可不用特殊治療，如果比較嚴重，可以到醫院由醫生進行阻塞切開、鼻淚管義管手術的方法治療。
3、結膜炎
炎症會導致眼結膜血管擴張和滲出，進而刺激結膜細胞產生更多的分泌物，形成眼屎或眼膿。建議在醫生的指導下使用醋酸潑尼鬆龍滴眼液、雙氯芬酸鈉滴眼液、複方硫痠軟骨素滴眼液等藥物消除炎症。
4、角膜炎
角膜炎引發眼角膜的炎症，可能會導致角膜周圍的眼結膜受到刺激和炎症，產生分泌物，形成眼屎。可使用珍珠明目滴眼液、色甘酸鈉滴眼液、鹽酸左氧氟沙星滴眼液等藥物，緩解症狀，但是新生兒用藥通常有較多禁忌，需要嚴格按照醫生要求用藥。
5、過敏
如果新生兒接觸到過敏原，可能會導致眼部發生過敏反應，導致眼屎增多、瘙癢等症狀發生，比如花粉、化妝品、動物皮屑等。可遵醫囑使用抗過敏藥物治療，比如鹽酸西替利嗪口服溶液、複方苯海拉明麻黃鹼糖漿、地氯雷他定幹混懸劑等。
日常注意新生兒用藥前，建議到醫院就診，進行相關檢查，明確具體病因，在醫生的指導下，選擇合適的方法治療，不可盲目用藥，避免引起不適。
