卵巢囊腫腹腔鏡意味着卵巢囊腫需要通過腹腔鏡手術切除。腹腔鏡手術一般是在患者全麻的狀態下，腫物剝除以及患側的輸卵管卵巢切除。卵巢囊腫腹腔鏡手術應在正規醫院進行操作，具體流程如下：
1、患者取膀胱截石位躺在手術牀上，醫生換上無菌服後，對患者腹部皮膚及會陰部進行常規消毒，消毒三次後鋪巾。之後麻醉師覈對病歷單給予患者麻醉。
2、麻醉生效後，醫生帶上無菌手套在患者腹部肚臍、左右側小腹及左上側各切開一釐米左右的切口，氣腹針插入腹腔，然後將二氧化碳氣體經由氣腹針注入腹腔內，從而建立氣腹。
3、將腹腔鏡和手術器械送入腹腔，探查盆腹腔情況，繼而切斷卵巢及輸卵管相關的系膜及韌帶。切開囊腫表面卵巢皮質，分離卵巢與囊腫間隙，以剪刀鈍性及銳性結合分離囊腫與卵巢間隙，剝離囊腫。
4、用細絲線和腸線縫合切除的創面，以及卵巢的切緣。
5、通過穿刺口把卵巢囊腫壁取出來，排空腹腔內二氧化碳氣體，取出腹腔鏡及各套管，常規縫合並貼上醫用創口貼止血，無異常情況，手術結束。
