隱匿性腎炎是臨牀常見病、多發病。多年的臨牀實踐可發證明，本病當以扶正祛邪爲治療原則。扶正者，補脾胃，益腎陰，調氣機，固脂液以達到增強體質。則當涼血、止血、化瘀、清熱、瀉火、祛溼，以此減輕蛋白尿和血尿，減輕或拮抗激素等西藥治療的副作用，提高療效，減少復發。故總結以下三個中醫治療原則，現分述如下。
1健脾補腎法本病之蛋白尿的病因病機常責之於脾腎之氣不足，脾失統攝，腎失封藏，腎不攝精，精氣外泄。故益氣，健脾，補腎，固精爲主要法則。運用黃芪、黨蔘系列的健脾之方藥，並在健脾之中佐以固澀之品，如芡實、金櫻子、山萸肉等，以達到消除蛋白尿之目的。
2清熱解毒法隱匿性腎炎爲免疫損傷性腎炎性疾病，在免疫性疾病中可以出現熱證。對此治療，除進行性外因治療(直接消除病原體，消除毒素)，尚需內因治療，即提高或調解機體的免疫功能，以增強或改善機體抗病能力的治療。藥理研究，清熱解毒利溼類中藥恰巧具備了這方面的作用。
3活血化瘀法雖然血液離經忘行，但出血必有瘀滯，且久病入絡，久病必瘀，治療本病宜採用活血化瘀之法，使瘀化血行，尿血自止。有報道提出，瘀血是腎小球疾病發展過程中形成的病理產物，同時又是使病機複雜化，病情纏綿難愈的一種致病因素，故活血化瘀療法爲提高臨牀療效的基本要素。
