膽囊結石不一定出現疼痛症狀，臨牀上有很多膽囊結石的患者，並不出現任何臨牀症狀，稱為靜止性結石，只是在彩超查體時才被發現，甚至有些患者可能終身不會出現疼痛症狀。但是臨牀上也有很多膽囊結石的患者，會出現臨牀症狀。
當膽囊結石出現疼痛時，常提示出現結石性膽囊炎，這些臨牀症狀主要是右上腹疼痛，嚴重的會出現膽絞痛，呈陣發性或持續性並陣發性加重，疼痛還可以向右肩背部放射，常伴有發熱、食慾減退、噁心、嘔吐、腹脹、黃疸等。查體右上腹可以出現明顯的壓痛，甚至可能出現反跳痛，墨菲氏徵陽性，肝區叩痛陽性。
