皰疹性咽峽炎是腸道病毒所引起的急性呼吸道感染性疾病，此類疾病傳染性比較強，一般傳染源是患病的寶寶和無症狀感染者，主要是由病原體通過呼吸道傳播、接觸傳播以及消化道傳播，常見的病毒是柯薩奇病毒、埃可病毒、單純皰疹病毒、EB病毒等等，如果是柯薩奇病毒引起的皰疹性咽峽炎，不具有傳染性，在病情好了之後是不會出現傳染現象的，而且在感染之後3~5天就可以恢復。如果是以上其他的病毒，通常在病情好了之後還會出現傳染的現象。
皰疹性咽峽炎的患者，建議在病情好轉之後或是剛剛恢復狀態，做好防護工作，避免再次傳染。尤其是在幼托機構中，應該更加註意及時隔離，避免再次接觸患有皰疹性咽峽炎的患者。
