通常情況下，頭孢克肟、頭孢克洛、頭孢丙烯三種藥物的區別是抗菌譜、治療效果、適用病症等方面有所不同，具體分析如下：
1、抗菌譜
頭孢克肟屬於第3代的頭孢菌素，頭孢克洛和頭孢丙烯都是第2代的頭孢菌素。
2、治療效果
頭孢克肟對於革蘭氏陰性菌的治療效果強於頭孢丙烯，對於革蘭氏陽性菌的效果弱於頭孢丙烯，頭孢克洛和頭孢丙烯的治療效果相近。
3、適用病症
頭孢克肟適用於治療扁桃體炎、支氣管炎、肺炎等疾病，頭孢克洛適用於治療咽炎、鼻炎、膀胱炎等疾病，頭孢丙烯適用於治療急性氣管炎、急性支氣管炎及中耳炎等疾病。
除以上區別外，還有其他區別，如成分、性狀等不同。一般情況下這三種藥物不會引起很大的不良反應，但長期服用可能會使胃腸感覺到不適，一定要遵醫囑服用藥物，以免引起副作用，對頭孢過敏者不要服用，如果服用後身體感覺不適，及時就醫治療。
