目前肝癌的治療是綜合治療，首選手術切除，能根治性切除的首選切除。切除的方法包括傳統開腹肝癌切除、腹腔鏡下肝癌切除。後者創傷小，恢復快。
能否手術及手術方式的選擇，需要醫生檢查結束後充分的評估，包括病人的身體條件、肝功能、剩餘肝臟體積、肝臟儲備功能等。不能行手術切除或手術切除風險高，病人身體條件不允許的，可以考慮行射頻消融（RFA）治療，對3cm以下的肝癌手術切除及射頻消融治療效果相當；其次不能手術的中晚期肝癌可以行介入治療，也就是經肝動脈灌注化療栓塞術，創傷也比較小，但需要反覆多次治療。
其餘治療方案包括靶向治療、系統化療、放療、放射性粒子植入治療等，均對肝癌的治療有一定的療效，而對符合條件、經濟條件較好的患者，肝移植是非常好的治療手段，但具體適合哪種治療方法，需要醫生根據病人的具體情況來決定。
