一般情況下，長期側睡一邊肩胛骨疼可能是睡姿不好、肌肉勞損、肩周炎等因素導致的。具體分析如下：
1、睡姿不好
太高或太硬的枕頭會使頭部向上挺，導致頸椎過度、肩膀僵硬，增加肩胛骨疼痛的風險。睡覺時最好選用適合自己身體的枕頭，保持頸部、肩部皆放鬆。
2、肌肉勞損
長時間保持同一姿勢，肩胛骨周圍的肌肉、韌帶和關節等結構可能會出現勞損和疲勞感，導致肩胛骨疼痛。如情況嚴重，患者可以直接到醫院，根據醫生建議服用尼美舒利膠囊、雙氯芬酸鈉緩釋片等藥物緩解。
3、肩周炎
長時間側睡可能會壓到肩部的軟組織，損傷肩袖肌腱，從而導致肩周炎及肩胛骨疼痛。患者可在醫生建議下短期服用非甾體抗炎藥緩解疼痛。常用藥物包括布洛芬緩釋片、依託考昔片等。
除此以外，還可能和神經受壓、神經根型頸椎病、肋骨骨折、類風溼關節炎等有關。如果肩胛骨疼痛持續或加重，建議及時到醫院進行檢查和診斷，然後選擇相應的方式治療，避免情況嚴重化。
