打了九價HPV疫苗第三針後手臂一直很痛，可能是生理因素導致的，也可能是病理因素導致的，如臂叢神經損傷、肱骨外上髁炎等。具體情況分析如下：
一、生理因素
九價HPV疫苗主要是爲了預防HPV感染所導致的宮頸癌疾病，患者打了九價HPV疫苗第三針後手臂一直很痛，可能是注射部位出現皮損導致的，屬於正常生理情況，一般通過保持個人清潔衛生的方式便可緩解。
二、病理因素
1、臂叢神經損傷
臂叢神經損傷可能是手臂部位的神經叢，受到外力強烈撞擊所引起的，當脊髓神經根牽拉手臂部位神經後，可能產生上述症狀。可以遵醫囑使用阿司匹林腸溶片、塞來昔布膠囊等藥物。
2、肱骨外上髁炎
肱骨外上髁炎可能是年齡因素、職業因素等引起的疾病，患者前臂伸肌肌腱部位會出現慢性損傷情況，從而產生該症狀，可以遵醫囑使用布洛芬乳膏、雙氯芬酸二乙胺乳膠劑等藥物進行治療。
除此之外，還可能是肘管綜合徵、骨關節炎、系統性紅斑狼瘡等導致的。建議在進行治療期間，不要參與劇烈的體育活動。
