長期鼻飼的併發症一般包括消化道功能減退、鼻腔黏膜炎症、吸入性肺炎。
1、消化道功能減退
長期鼻飼可能會因爲不能通過口腔咀嚼以及吞嚥食物，以及食糜進入胃部以後不能有效刺激消化液產生，引起消化功能減退。
2、鼻腔黏膜炎症
如果長期鼻飼可能會導致鼻腔黏膜產生機械性損傷，出現鼻腔黏膜炎症，表現爲黏膜糜爛、出血等現象。
3、吸入性肺炎
鼻飼以後胃內的食物一般比較容易從賁門、食管、口腔流出，所以比較容易誤吸到氣管引起吸入性肺炎。
另外，也可能會引起鼻中隔膿腫甚至穿孔，需要注意護理。
