醫改辦入駐衛計委一年不到，衛生醫療界重新探討其歸屬問題。一位接近衛計委人士稱，未來醫改辦迴歸發改委的可能性比較大。
“醫改辦調入衛計委之後，很多醫改專家委員會委員都覺得協調起來比較難，自從到了衛計委，我們還沒有開過一次會。”國務院醫改專家諮詢委員會委員、復旦大學教授胡善聯認爲，醫改辦應該設在綜合部門下面，比較容易協調。
醫改辦緣起於幾年前的醫改爭論。2006年6月30日，國務院成立以國家發改委、衛生部牽頭，財政部、人力資源和社會保障部等16個部門參加的深化醫藥衛生體制改革部際協調工作小組(後改爲國務院深化醫藥衛生體制改革領導小組)，下設辦公室便是國務院醫改辦。
2008年12月，國務院將該小組升級爲國務院深化醫藥衛生體制改革領導小組，李克強擔任組長。
2010年，國務院醫改辦印發通知稱，中編辦批覆國務院醫改辦公室的機構設置，醫改辦成爲常設機構。
在2009年4月推出深化醫改方案之後的四年，也就是2013年5月17日，國家衛生計生委成立，在其“三定”方案中，原衛生部的醫政司和醫管司合併組成醫政醫管司，並新設立體制改革司，原本設在發改委的國務院醫改辦職能也被調入其中。
然而，原設在發改委旗下的醫改辦人員中，只有醫改辦主任來到了衛計委，其他工作人員並未隨從到衛計委。
北京大學政府管理學院教授顧昕在接受《第一財經日報》採訪時表示：“醫改辦不應該放在與醫改有任何相關的利益部門，特別是衛計委、人保部和發改委，這三個部門都是醫改的對象。”
顧昕解釋，人保部中有兩個利益部門與醫改相關，一個是人事部門，一個是醫療保險部門，這兩個部門在醫改中都是需要改革的;而發改委手中握着藥品定價和醫療服務價格的定價，這事關醫改的重點;衛計委管着公立醫院，這三大部門都與醫改有着利益關係。在他看來，醫改辦只有放到中央深化改革小組下。
北京大學教授李玲也認爲：“醫改應該在綜合部門下面，易於協調，因爲醫改是一個系統的改革。”對於醫改辦是否能夠放到利益相關部門發改委，李玲稱，醫療服務價格和藥品價格的定價，應該有一個與經濟發展水平相適應的動態調整。
顧昕認爲，無論醫改辦放到什麼地方，最重要的是解決當前醫改存在的問題，特別是公立醫院的管辦分離以及醫療服務定價和藥品定價，要去行政化，真正用市場機制來配置資源。
“十八屆三中全會指出，要緊緊圍繞市場在資源配置中的決定作用深化經濟體制改革。而當前的醫療服務體制價格以及藥品價格的定價機制，仍然是屬於政府行政化，在未來改革中，這是必須要解決和面對的問題。”顧昕說。
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