“吸菸有害健康”，這是20世紀世界醫學界公認的一個最基本的科學結論，它有充分的臨牀、實驗室和流行病學證據。那麼吸菸會引起什麼疾病呢？
肺癌最重要的發病原因是吸菸。有證據表明，吸菸者患肺癌的危險性是不吸菸者的10倍，每日吸菸兩包以上的重度吸菸者患肺癌的危險性比不吸菸者增加30倍。美國1990年的統計表明，86%的男性和49%的女性肺癌是由吸菸引起的。即使是被動吸菸患肺癌的危險也要增加24%。
美國癌症協會的兩次大規模的百萬人羣追蹤調查表明，無論一天吸幾支煙，吸菸男性的肺癌死亡率是不吸菸者的21倍，其配偶肺癌死亡率是不吸菸者的12倍。每日吸菸量與肺癌發生率成正比。吸菸量越大、吸菸年限越長、開始吸菸年齡越早，肺癌死亡率越高。
英國和美國的調查都表明，低焦油煙並沒有使肺癌死亡率下降。據統計，控制吸菸可減少大約80%以上的肺癌和30%的癌症總死亡率。戒菸10年可降低肺癌發生危險性50%以上；戒菸15年發病危險與不吸菸者已無差別。50歲之前戒菸危險性的下降更爲顯著。
與從不吸菸者相比，吸菸者患口腔癌的危險要高7～10倍。如果既吸菸又飲酒，二者的危害會發生協同放大，這就是菸酒成癮者患口腔癌的危險要比從不碰菸酒的人高150倍的原因。
2006年，我國有一項研究，涉及103個地區的1.5億人口，結果表明：吸菸是食管癌的重要危險因素，每日吸菸支數與食管癌的死亡風險呈正相關，吸菸年限與食管癌的死亡風險同樣呈正相關。
2009年，日本的研究發現，吸菸者胃癌風險爲不吸菸者的1.8倍，而既有幽門螺桿菌感染又吸菸者比沒有幽門螺桿菌感染又不吸菸者高10倍。1997年的薈萃分析結果表明，吸菸者與不吸菸者胃癌發生危險比爲1.5～1.6，並存在量效關係。尤其吃飯時吸菸，更不是好習慣，因爲菸草中的有害物質隨食物吞下，可以直接與胃黏膜接觸。
胰腺癌是一種惡性程度很高的腫瘤，吸菸是唯一公認與其發病有明確關係的危險因素。美國的研究顯示，每天吸菸25支以上，患胰腺癌的危險是不吸菸的4倍。日本的研究表明，開始吸菸的年齡越小，吸菸量越大，就越容易患胰腺癌，其死亡率也隨吸菸量的增加而上升。加拿大的研究還發現，胰腺癌的發生與被動吸菸有關，被動吸菸者與從未接觸過吸菸環境者相比，患病危險顯著增高。英國的研究揭示，菸草中致癌因子可引起胰腺Kr-as基因突變，進而發生癌變。
2008年，意大利學者對已經發表的106項、涉及4萬人的觀察性研究進行薈萃分析，結果表明：吸菸者比不吸菸者死於結直腸癌的風險高25%。每日吸菸越多、時間越長，患病風險越高。而且吸菸與直腸癌之間的關聯性比與結腸癌之間的關聯性更強。
主動吸菸和被動吸菸都可以導致乳腺癌。
國外有研究顯示，主動吸菸者患乳腺癌的危險增加46%。國內的研究表明，被動吸菸女性患乳腺癌的風險是無被動吸菸女性的1.94倍。國外的研究還表明，吸菸能影響乳腺癌的早期診斷，影響乳腺X線照射診斷的準確度。吸菸可使乳腺癌的復發機會增加，病死率增高，生存期縮短。
吸菸是慢性阻塞性肺病致病的主要危險因素。吸菸易導致呼吸道反覆感染，明顯增加肺纖維化的風險；被動吸菸環境可加重兒童哮喘發作。
2006年，美國的研究表明，主動和被動吸菸都影響糖代謝，可以使年輕人糖代謝異常，增加患糖尿病的危險性。
2003年，美國的研究顯示，吸菸可使2型糖尿病患者的氧化應激反應增強，導致腎臟進行性損傷，尿蛋白排泄量增加。
2008年，美國的研究報告顯示，吸菸與年輕婦女缺血性腦卒中發病危險存在顯著量效關係。
遼寧省某醫院統計，他們收治的動脈硬化閉塞症患者，95%以上是重度吸菸者。所謂重度吸菸，是指每天吸一包煙，持續20年；或每天吸兩包煙，持續10年。
2007年國內報道，吸菸是反流性食管炎發病的危險因素。
2005年，臺灣的研究發現，中度至重度雄激素性脫髮與吸菸、當前每日吸菸量多於20支及吸菸強度均呈顯著正相關。
美國一項研究發現，大量吸菸者患銀屑病的危險較大，其危險只有在戒菸20年後才降至正常。出生前和兒童期被動吸菸也與銀屑病危險性的增高有關。
2006年，美國的研究表明，老年吸菸者比不吸菸者的皮膚粗糙。
