膽管結石主要是指肝內膽管結石和膽總管結石，而膽結石通常是指膽囊結石。膽結石和膽管結石，它的區別主要在表現在以下兩點：
第一 、從結石的成分和病因。膽囊結石的成分主要是膽固醇性的結石，病因主要是膽汁酸與膽固醇溶解失平衡，膽囊收縮功能減退有關。而膽管結石的成分主要是，膽色素性結石或以膽色素爲主的混合性結石，病因主要與膽道細菌感染有關。
第二 、從症狀和治療上面區別。膽囊結石多數是靜止性結石或者無症狀性結石，一部分病人出現急性膽囊炎，主要表現爲以右上腹疼痛不適爲主，通常很少出現黃疸，而膽管結石有腹痛，而且由於有膽道梗阻，所以容易出現黃疸。在治療上，對於靜止性的膽囊結石通常密切觀察，如果發作急性膽囊炎或者反覆發作慢性膽囊炎，可以考慮手術治療，手術治療通常採用腹腔鏡手術。而膽管結石一經發現，通常需要及時手術治療，否則容易發作急性膽管炎，甚至感染性休克。
