在用藥前，要注意檢查所用藥品的藥名、濃度、有效期是否與包裝相符，眼藥水內有無混濁或絮狀物，有無顏色變化等。以懸浮液劑型製成的眼藥水，使用前應搖晃均勻。點藥前要先洗手，病人取臥位或坐位，頭後仰，眼睛睜開向上看，可用食指與拇指分開上下眼瞼，將1～2滴眼藥滴在靠外側眼角的結膜囊內，稍提一下上眼瞼，讓藥液儘可能保留在結膜囊內，然後輕輕閉眼2～3分鐘。
如果同時點兩種或兩種以上藥，應在一種藥點用後，間隔5分鐘。應先滴刺激性弱的藥物，後滴刺激性強的藥物。用藥時不要使眼藥瓶口接觸眼瞼及睫毛；避免將眼藥直接滴在黑眼球上；雙眼都需要用藥者，應按先健眼、後病眼的順序；雙眼都有病者，應按先輕後重的順序。有些眼藥水在固定的時間點用才能發揮最大的作用，因此，應該在什麼時間點眼藥水，最好遵照醫囑點用。
點眼藥後最好按壓淚囊區（內側眼角稍偏下方）2～3分鐘，防止眼藥通過淚小管和鼻淚管流失。塗眼藥膏的體位同點眼藥水一樣，用食指或拇指撥開下眼瞼，將眼膏水平方向塗抹在下眼瞼和眼球交界的小溝內（醫學上叫下穹隆部），再輕輕使之閉合，將藥膏包裹其中。若滴眼液和眼藥膏同時使用，應先用滴眼液，間隔一定時間後再用眼藥膏。
