滴葉黃素眼藥水眼睛疼，可能是由於生理原因或使用方式錯誤、滴眼液變質等病理因素所致，需要根據不同病因選擇不同的治療方法。
一、生理原因
一般情況下，滴眼液會引起局部酸鹼度的暫時改變，引起眼睛的疼痛，這類病人一般要閉眼5分鐘，這段時間內，淚液會中和滴眼液的酸鹼度，之後症狀就會減輕，不需要做特別的治療。
二、病理因素
1、使用方式錯誤
通常，人類的眼角膜中含有大量的感覺神經纖維，若病人將滴眼液直接塗在角膜上，會刺激角膜上的感覺神經。會引起眼部疼痛，因此，滴眼液一定要放在結膜囊裏面，而不是直接滴到角膜上。
2、滴眼液變質
眼藥水一旦接觸到眼睛會感到刺痛，有可能是因爲滴眼液變質，比如喹諾酮類的眼藥水、氧氟沙星滴眼液、左氧氟沙星滴眼液等。使用後會出現刺痛，出現這種情況，建議病人馬上用清水沖洗，若沖洗後仍然感覺不舒服，應及時就醫。
除此之外，還可能是過敏反應所致，在日常生活中要注意清淡的飲食，避免食用辛辣刺激性的食物。
