腦穿刺對大腦的副作用一般包括顱內壓增高、腦水腫，或是感染、腦神經功能障礙等。
1、顱內壓增高、腦水腫
腦穿刺的過程中有可能會使腦血管受到損傷，血管受到損傷後會導致出血量增多，使血液在大腦裏面聚積，導致出現顱內壓增高、腦積水等現象，有些情況嚴重的還可能會形成腦疝。
2、感染
在進行腦穿刺的時候，通常會有失血現象，而且還可能會對硬腦膜及腦膜造成創傷，也有可能使外界的細菌進入大腦內，並在腦部生存，引發腦部感染，造成急性腦膜炎。
3、腦神經功能障礙
腦穿刺具有一定的風險性，如果做腦穿刺的時候，穿刺深度或位置超過正常，有可能會對腦神經造成損傷，使患者出現嗜睡、昏迷等症狀，甚至危及生命。
如果需要做腦穿刺，建議到正規醫院由專業醫生操作，降低腦穿刺的風險。
