睡覺醒來身體有痕跡且有疼痛感可能是生理原因導致的，也可能是蟲咬反應、人工性蕁麻疹等病理原因引起的，應根據具體誘因予以一般治療、藥物治療。具體分析如下：
一、生理原因
如果睡覺環境較乾燥，可能會使皮膚出現刺癢感，在抓撓後可能會使皮膚受到損傷，致使上述情況出現。一般可隨時間逐步恢復。
二、病理原因
1、蟲咬反應
蟲咬反應是人體被昆蟲叮咬後產生的過敏反應，如果在睡覺使被叮咬，可能會誘發該反應，表現出上述反應。針對這一情況，建議遵醫囑使用爐甘石洗劑、風油精等予以改善。
2、人工性蕁麻疹
人工性蕁麻疹的影響因素包括遺傳因素、環境因素等，該疾病可能會在機械性刺激下使肥大細胞釋放血管活性介質，出現上述症狀。對此，可在醫生指導下選擇鹽酸左西替利嗪口服溶液、皮敏消膠囊等進行治療。
除了上述原因，該情況還可能是溼疹、隱翅蟲皮炎、疥瘡等原因造成的。建議及時就診，積極配合醫生治療。
