果糖和低聚果糖的果糖聚合物不同、作用不同，用途也不同。
1、果糖聚合物不同
果糖中的果糖聚合物通常比較多，超過20個以上，低聚果糖中的果糖聚合物比較少，在20個以下。
2、作用不同
果糖屬於一種水溶性膳食纖維，能夠起到降低膽固醇的作用，也能夠控制血糖，還可以有效的預防便祕。低聚果糖通常存在在蔬菜或者水果中，具有比較強的雙歧因子以及水溶性膳食纖維，適當的進食能夠提高對鈣離子的吸收，從而增加骨密度。另外，低聚果糖對腸黏膜細胞具有一定的保護作用，能夠抑制有害菌。
3、用途不同
果糖通常一般添加在化妝品中，能夠抑制面部的有害菌，從而有效地減少色素沉着的現象。低聚果糖通常添加在奶粉中，能夠調節微生態平衡，從而使奶粉容易消化和吸收。
